[1]庞国庆,严沛鑫,周康乔.基于机器学习的抗乳腺癌候选药物筛选模型优化[J].南通职业大学学报,2023,37(02):67-72+104.[doi:10.3969/j.issn.1008-5327.2023.02.015]
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基于机器学习的抗乳腺癌候选药物筛选模型优化(
)
《南通职业大学学报》[ISSN:1008-5327/CN:32-1528/G4]
- 卷:
-
37
- 期数:
-
2023年02
- 页码:
-
67-72+104
- 栏目:
-
数学与建模
- 出版日期:
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2023-08-01
文章信息/Info
- 作者:
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庞国庆1; 严沛鑫2; 周康乔3
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1. 南通大学 经济与管理学院, 江苏 南通 226019; 2. 南京大学 电子科学与工程学院, 南京 210023;3. 河海大学 理学院, 南京 211100
- 关键词:
-
乳腺癌; 药物筛选; 分子描述符; 生物活性预测; Spearman相关系数; 最大互信息系数; 随机森林; 岭回归
- 分类号:
-
O213;R453
- DOI:
-
10.3969/j.issn.1008-5327.2023.02.015
- 文献标志码:
-
A
- 摘要:
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雌激素受体α亚型(Estrogen receptors alpha,ERα)被认为是治疗乳腺癌的重要靶标,对于治疗乳腺癌非常关键。为准确找出能抑制ERα活性的化合物,以504个分子描述符作为研究变量,采用Spearman相关系数、最大互信息系数和随机森林特征选择三种方法,分别筛选出排名前30的分子描述符,综合三种方法的结果,使用基于秩的变量选择算法选出前20个对生物活性最具显著影响的分子描述符,并分别建立岭回归和随机森林非线性回归模型对其进行比较。结果表明,随机森林模型方法的预测效果更好,可用于化合物对ERα生物活性值的预测。
更新日期/Last Update:
2023-08-24